陈实功尤其擅长外科，做过许多外科手术，制作了许多医疗器械，创造了许多新的疗法，在群众中享有很高的声誉。至今仍被各国研究世界医学史的学者专家称为“再世华佗”。
陈实功根据自己精湛的医学理论和40多年的临床经验，结合具体病例，系统整理成《外科正宗》一书。全书共四卷，分157类，对外科诸症的病因、病理、预后、治疗法则，具体方药和手术，都一一记载。《外科正宗》内容丰富，层次井然，论治精细，并附有治被实例和图形。这本书直到现在仍在印行，作为中医学的教材，还传到日本。
陈实功与南通的桥 据《通州志》载，“州南多圮梁，实新其半”。明代著名医学家陈实功，共建桥五座，其中木桥易石两座，新建三座。
易石的两座桥一是通济桥，二是涧桥。通济桥即南吊桥，也就是现在的长桥。该桥建于元至正年间（元惠宗年号）。明天启元年（1624年）改为石桥。涧桥在如今的段加坝小园新村内，当年这座桥是城区与郊区分界的标志物，也是保留至今最完好的一座石桥，已历经500多年的风雨沧桑。
陈实功新建的三座桥，是段家桥、永丰桥、白塘桥。这三座桥的地点，据《通州志》载：“涧桥在南门外一里……又一里曰段家桥，二里曰永丰桥，东路三里曰白塘桥。”现今，段家桥、永丰桥以不复存在，白塘桥尚在，虽已不是原样，但其名称未改。
关于陈实功修通济桥，民间流传着一个动人的传说：
一次，陈实功出诊途中遇一乞丐求乞，陈先生先施食，后慷慨解囊乞丐不谢，只道：“沧浪亭下沧浪草，任何搭背医得好。”说罢大笑而去。后来，陈先生果然找到了沧浪草，并为苏州抚台慕天颜之母医好了病。慕抚台要重谢，陈说，看病不是为了钱，乃为救人生命。你们做官的也应关心百姓疾苦才好。通州的南吊桥为营民往来要道，兵马践踏，一年两易，行人不便，能换成石桥就好了。慕抚台应诺，留陈住了几月。陈回到通州，一看，木桥已改成了石桥，当时，通州所有的桥梁，要数这座最长，故起名为“长桥”。
陈实功一生做的好事很多。他八十二岁去世，“通人无少长，靡不陨涕云。”
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